ライハルト・ハイドリヒ総督を暗殺した容疑者の集団が、1942年6月18日にチェコスロバキアの首都プラハのキュリロス・メトディオス教会にナチス・ドイツ軍の国家秘密警察であるゲシュタポに追い込まれた。カール=ヘルマン・フランクの命令を受けた親衛隊(SS)が突入した。その直後に暗殺者と容疑者ら全員が銃殺された。その後に、教会から死体が外地に引きずり出され、秘密警察や親衛隊が取り囲んで見下した。
1939年9月に、ハインドリヒはナチ警察の部署を統括して、強力なテロ機関である国家保安本部(RSHA)に変貌させた。1941年12月27日にハイドリヒは、プラハの総督に赴任した。12月15日に、プラハ聖堂横の広場で、抵抗運動者を機関銃で公開処刑した。ハイドリヒは、プラハの虐殺者と呼称された。チェコ首相のアロイス・エリアスを、1942年6月6月19日に死刑を執行した。
1942年5月27日に午前10時32分にプラハの地下グループは、クビスの所持していた爆弾が、ハイドリヒの乗用車を爆破した。ガブツィクのステン銃は作動しなかった。トラックの荷台で、負傷したハイドリヒが搬送された。6月4日にハイドリヒは負傷による感染症で死亡した。8人の暗殺者と抵抗運動者は、ギリシア正教のキュリロス・メトディオス教会の地下室に潜伏していた。6月18日に親衛隊の戦闘部隊が、地下室に突入した。銃撃された血まみれの死体や自害した死体が散乱した。
ゲシュタポは、ハイドリヒ暗殺事件後にチェコスロバキア全土に戒厳令が施行され、ゲシュタポは、ハイドリヒの暗殺に対するチェコ市民に復讐するために、約13,000人を大量逮捕して、そのうち約600人を武器の不法所持で処刑した。プラハ北西のリディツェ村は6月10日に、男性と15歳以上の少年を合わせて約199が処刑され、女性はラーヴェンスブリュックの強制収容所に送還された。6月24日に、レジャキ村が破壊され、成人の33人の男女全員が射殺された。