1941年11月から12月にかけて、ウクライナ地域のクリミアのケルチ近郊のバゲロヴォ村付近の対戦車溝で、数千人のユダヤ人がナチス・ドイツ占領軍によって射殺された。死体は、バゲロヴォの堀の対戦車塹壕に投げ込んだ。約7千人の虐殺された死体の裸の足や腕が雪の下から突き出ていた。それには、約245人の子供と学童の死体も含まれた。暗い空の下で半凍った冬の風景の中に、ゆがんだ死体の残骸、制服を着た兵士などの死体の中で、ケルチ地域の婦人らが、身内の死体を探索して検死した。1942年1月に、調査官や記者が、ナチス・ドイツ軍の戦争犯罪を記録した。バゲロフの堀の資料は、ホロコーストとナチス侵略者の戦争犯罪を説明する最初の資料の一つとなった。
1939年にはクリミアASSRに、約65,452人のユダヤ人(人口の約5.8%)が居住して、そのうち約7000人以上がクリムチャク人であった。その大半(約47,387人)は都市部に定住した。クリミアからの避難は、すでに1941年7月から始まった。ナチス・ドイツ軍占領下で、約3万4千人のクリミア系ユダヤ人がナチス・ドイツ軍侵攻の前夜に家を避難できた。残存した不幸な住民の抹殺は、アインザッツグルッペDの隊員を中心とする懲罰部隊である死の部隊がホロコーストを行った。
1941年11月28日に、ケルチに新たなナチス・ドイツのゲシュタポ命令が掲示されて、すべてのユダヤ人は11月29日の午前8時から12時まで、3日分の食料を持ってセナヤ広場に出頭するように命じた。ナチス・ドイツは、姿を見せないと公開処刑にすると脅した。 正午までに、少年、少女、老若男女、老人、妊婦など、約7000人以上の人々が広場に集まった。ゲシュタポは、全員を市の刑務所に送った。12月1日から5日に、ドイツ軍は刑務所から囚人を、大きな対戦車堀が掘られたケルチ近郊のバゲロヴォ村に強制連行して、無差別に銃殺した。
すでに1941年11月から12月、都市部にいた地元のユダヤ人とクリミア・タタール人の大部分が駆除された。その後も、特に1942年の再占領後のケルチとフェオドシアでは、個々の潜伏した集団や個人を捜索して抹殺が絶え間なく続けられ。ユダヤ人、クリムチャク人、混血家族への人狩は、1944年4月から5月のクリミア半島解放まで続けられた。ユダヤ人とクリミア人の犠牲者は合計で約4万人に達した。
第二次世界大戦にてクリミア半島のケルチは、1941年11月にドイツ軍に占領された。1941年12月31日に、ソ連軍が、ケルチを奪還した。1942年にドイツ軍が再びケルチを占領した。ソ連軍はケルチ半島の戦いで約16万人以上の兵士が犠牲となり、死亡または捕虜となった。1943年10月31日、再びソ連軍による上陸作戦が開始され、1944年4月11日に、ケルチはソ連が占領して支配した。