1900年に義和団の乱で、義和団の指導者が断頭される斬首を、庶民の至近距離から生鮮市場で公開処刑された。告発された義和団の指導者は全員厳しく追及され、公開処刑された。8カ国連合軍は賠償金と称して北京市内から略奪し、罪のない市民を非人道的に殺害した。数千人の義和団の容疑者が逮捕され、裁判にかけられ、ある者は即座に処刑された。義和団の乱後に逮捕された義和団員の中には、日本刀で殺された者もいた。義和団運動後の処刑は、裁判にかけられ、多くは略式に終わり、義和団と告発されて無罪になった記録はなく、ほぼ例外なく全員殺された。
アヘン戦争でイギリスに敗戦後の19世紀末に、清国は、欧米列強の勢力やキリスト教の宣教師たちの影響力が強まった。最後の一撃は日本軍が、1894年から1895年の日清戦争で、清国海軍を全滅して台湾海峡まで割譲させた。清朝の弱体化と列強の圧迫により、清国の不満が、最終的に山東省の致命的な干ばつが起点となり、1897年3月から義和団が反乱した。
義和団は、武器は拳と刀で、呪文や儀式で神の憑依であった。1897年11月1日に義和団がドイツ人宣教師ゲオルグ・ステンツの家を襲撃して、神父2人を殺害した。1900年初期には、義和団は巨大な秘密結社となり、山東省から北京、天津に北上して侵攻した。義和団は呪文を唱え、儀式の硬気功で、剣や弾丸が体を貫かないと洗脳された。キリスト教の布教が、中国の伝統的な道教、仏教、儒教の信仰を脅かし、古代の神々や先祖に雨乞いを無視して、干ばつの罰を与えたのはキリスト教徒だと本気で信じた。戦火の中で、何人ものキリスト教徒が義和団に殺害された。
1899年に義和団は蜂起に伴って、多くの州都を占拠した。中国の満州族であった清朝は、当初は強硬に義和団を鎮圧したが、その後義和団は呪文を唱え、神の魔法で、外国人の排斥を期待して、1900年初頭に西太后は豹変して、義和団を支持する勅令を発した。北京の大使館を包囲した義和団に対抗するイギリス、フランス、オーストリア・ハンガリー、ロシア、アメリカ、イタリア、ドイツ、日本が総勢5万5千人の兵士が、北京に塘沽の河口から上陸した。多くは日本軍（2万1千人近く）から、ロシア軍が1万3千人、英連邦諸国が約1万2千人、フランスとアメリカが各約3千5百人、その他は少なかった。
清国軍の兵士たちは、8カ国連合軍と戦う義和団を支援して戦った。1900年6月初旬、清国軍と義和団は、約2000人の八カ国連合軍を撃破した。天津の戦いは、義和団の乱の中で最も血生臭い戦いとなった。義和団と清国軍は天津と近郊を猛攻した後も、7月13日夜から14日未明まで天津の戦いを続けた。その直後に、清国軍は闇に紛れて城門を逃避した。
1900年7月初旬には、北京の大使館街の外国代表団やキリスト教徒に弾薬や食料の供給が途絶え、清国軍が大使館街に義和団の攻撃を放った。最終的に約38人の警備員が殺害され、約55人が大使館エリアで負傷した。7月17日に清国が停戦を宣言して、1ヶ月間も攻撃した義和団の銃撃が突然止み、救援隊の出現を願った。8月13日に、8カ国連合軍が北京に接近すると、義和団は再び大使館周辺に激しい銃撃を開始した。8月14日午後、八カ国連合軍が大使館周辺に到達し、義和団の包囲網を解放した。8月15日未明に、外国軍が北京の占領を祝っている最中に、老女と農民姿の青年が牛車に乗って、西太后と光緒帝が紫禁城から西安に逃避し、連合軍は追わなかった。義和団の乱の後、清朝は窮地に立たされた。西太后は外国の和平提案を受け入れた。1901年9月7日に、李鴻章と清玉祥が新条約に調印した。清国は約9億8000万テール以上の銀を、39年以内に外国政府に支払いを要求された。中国の経済賠償で、帝国主義列強は次第に力をつけ、より多くのキリスト教宣教師を中国に送り込んだ。
