1999年1月6日に、インドネシア政府の国家人権委員会がアチェを調査した。1月9日の夜明け頃に、インドネシア軍の機動部隊は、ウィバワ99作戦によりカンダン村でGAMを捜索して掃討した。逮捕した自由アチェ運動(GAM)の容疑者約38人をインドネシア青年国民委員会(KNPI)のビルに強制連行して勾留した。KNPIビルに勾留者のうち、約10人は北アチェ県警察にて拷問されて、超法規的処刑が執行された。さらに約50人以上のインドネシア軍の混成隊が、北アチェ県警察の勾留者を襲撃して暴行した。その犠牲者の約27人が重態となり病院に搬送されて、そのうち約4人が死亡した。インドネシア軍の容疑者は、KNPIビル事件で軍事法廷で責任が追求された。国軍兵士の約4人が免職で7年の懲役刑となった。司令官の曹長も、6年の懲役刑を宣告された。
アチェ特別州は、インドネシアのスマトラ島の最北端で、首都ジャカルタから約1600kmにある。1970年代半ばまでに、アチェの天然資源に対してインドネシア政府は弾圧して、多くの分離抵抗運動を弾圧して、多くの指導者を殺害あるいは逮捕した。1989年に再び自由アチェ運動が蜂起した。1990年から1998年までアチェを軍事作戦地域(DOM)に指定した。スハルト政権が、弾圧して虐待と虐殺した。日本の円借款で建設した液化天然ガス(LNG)の精製をするアルン社の敷地内に設置されたインドネシア軍の拷問施設で、アチェの市民が、誘拐、拷問、法律を無視した超法規的に処刑された。
1989年から1990年に、約6,000人のインドネシア軍がアチェの反乱鎮圧に派遣された。アチェ市民の数千人が殺害されて、行方不明、拷問、強姦、逮捕されて勾留された。1992年6月までに約37人の市民と約12人の運動家が、裁判で有罪となり処刑された。特別軍事作戦で、インドネシア軍に強大な権力と虐待と虐殺の特権を与えた。1989年から1991年に少なくとも約2,000人が殺害された。国連は、東チモールを監視したが、イスラム教徒であるアチェは無視した。1998年5月21日にスハルト政権が打倒されて、アチェの軍事作戦地域が解除された。しかし、解除後も、自由アチェ運動に対抗してインドネシア軍はアチェを支配して弾圧を継続した。2004年12月16日のスマトラ島沖地震でアチェは壊滅した。2005年8月に自由アチェ運動はインドネシア政府と和平を締結した。
