シアヌークの命令で、カンボジア軍の指揮官であるロン・ノルは、1960年代に捕獲されたクメール・セレイ(Khmer Serei)の反政府運動に対して公開の処刑する組織を結成した。 その後のカンボジア内戦では、カンボジア王国の政府軍は、反政府運動の共産主義の兵士らの首切りした頭部を戦勝の賞金として持ち帰った。ロン・ノルは、1960年にカンボジア王国軍の最高司令官に任命された。政治と司法の腐敗と経済的困窮の不平と不安から各地の農村の農民が蜂起した。カンボジア王国軍と国家警察は、1967年から1968年にサムラウト(Samlaut)地域の農民主導の蜂起を弾圧して、虐待と虐殺した。政府軍兵士と警察は、反逆者からの切断した頭部を首都プノンペンに送還すると賞金を報奨された。空爆から掃討により、サムラウト地域の約14,000人以上の農民らが山林に逃亡した。
クメール・セレイの起源は、第二次世界大戦後のフランス植民地時代のカンボジア国境内で独立活動派の武装勢力であった。第二次世界大戦中の日本占領下では、カンボジア独立運動はほとんど成功しなかった。第ニ次世界大戦後にカンボジアはノロドム・シアヌーク王のもとで1953年に独立した。クメール・セレイは、主にタイと南ベトナムの国境地域で反政府活動をした。アメリカ合衆国は、クメール・セレイはシアヌーク政権を打倒できるように、アメリカ合衆国の中央情報局(CIA)からの資金提供を受けていた。
クメール・セイは、タイとベトナム国境の付近のクメール・クロム地方の独立を求めて、1960年代に南ベトナム解放戦線との衝突が頻発した。シアヌークに対する武力闘争を維持するために、クメール・セレイの反政府非正規軍を組織した。主にベトナムのメコンデルタのベトナム南西部のクメール・クロム地域の少数民族派の間で徴兵して、秘密の反シアヌークのラジオ放送を行った。カンボジア政権はクメール・クロムの反乱を深刻に捉えた。その疑惑の後に、シアヌーク王子がカンボジア統治中に、約1,000人ものクメール・セレイの容疑者を逮捕して処刑した。1963年には、右派の反政府民兵組織であるクメール・セレイの幹部であるブリーブ・イン(Preap In)らが、シアヌーク王子と直接に独立の交渉した。その交渉の失敗に終わり、カンボジア政府はクメール・セイの幹部を逮捕して1964年1月に公開の死刑が執行され、シアヌーク政権は、1965年にアメリカからの支援の拒否を示唆した。ロン・ノルは、1970年3月18日に国外の北京を訪問したシアヌークを、軍事クーデターで打倒して、アメリカ合衆国はロン・ノルを支援した。