イスラム国では、イスラム教に対する他宗教・他宗派には敵対した。イスラム教に対する背教罪は死刑に相当する。イスマーイール派の信徒とされる市民に対して、イスラム国では背教罪で打首の死刑を執行した。イラク戦争により、イラクはスンニ派政権からシーア派政権に転換された。イスラム国が2014年6月にイスラム教のスンニ派の過激組織がイラクの北部のモスル地域を制圧した。その後12月にイラクとシリアの国境地帯に国家の独立を宣言した。2015年1月に支持者の各地で攻撃を呼びかける声明を出し、世界中にテロが多発した。2017年11月に撲滅された。
イスラム教社会の約90％はスンニ派と約10%のシーア派構成される。比率ではスンニ派がシーア派を大幅に上回っている。スンニ派は、ムハンマドの死後、その後継者であるカリフが信者から選ばれた。シーア派は、預言者ムハンマドの後継者問題から、多数派のイスラム共同体から分離して第4代目の血脈を導く正統カリフをアリーとした信徒である。第十二イマーム派は、イスラム共同体の指導者である第12代目ムハンマドが、お隠れになり、将来に救世主として再臨する信徒である。シーア派に対して、イスラム国やイラク・シリアのスンニ派の過激組織が激しく嫌悪して敵対した。シリアのアサド大統領派閥は、シーア派の一派であるアラウィー派である。シーア派の一派で、7代目のイマーム以降の継承が異なるのがイスマーイール派である。キリスト教徒は、イラクでは人口の約3%、シリアでは約8%を占める。キリスト教徒しユダヤ教徒は、啓典の民として人頭税で統治した被保護民となり、イスラムの改宗を強要された。イスラム国を撲滅したクルド人は、イラク北部やアナトリア南東部に居住したゾロアスター・マニ・キリスト教やその他の要素も混在したヤジード派である。イスラム国からは、悪魔崇拝として虐待され、迫害を受けた。
