日中戦争中に、日本軍の731部隊が1936年から終戦まで、最も極秘に、国際的に禁忌である人体実験と細菌攻撃の研究をした。中国人らの囚人の約4人にペストノミを散布して、全員感染させてベットに苦しみ横たわった。チフス菌の砂糖水を強制的に飲水させて細菌感染をさせて、約12人が死亡した。チフス菌を注射器で果物に注射して、中国人の約5人に強制的に食べさせ、全員が感染した。人体ワクチン実験は、約50人の囚人で実験した。大量感染を引き起こす細菌爆弾の研究は約10人以上の囚人で実験した。チフス菌の細菌弾を空中や杭上で爆破して、頭から菌を落下して、約半数が死亡した。731部隊で関東軍の凍傷研究で、極寒期の零下約20度に囚人を外に出して、扇風機をかけて凍傷を人工的に作った。1940年12月頃に約5人の中国人の囚人の両手が全て壊死して黒化していた。絶食約3日や一昼夜不眠などで、零度の氷水に指を約30分浸けて凍傷にした。 日本軍は日本に反発する中国やソ連の人を匪賊と呼び、スパイや思想犯を人体材料にした。日本軍は日本に反発する中国やソ連の人を匪賊と呼び、スパイや思想犯を人体材料にした。囚人は頭を丸坊主に刈られて、「マルタ」と呼ばれた囚人は頭を丸坊主に刈られて、悲惨な人材実験をされた。
日中戦争に細菌兵器の開発を行った日本軍の秘密部隊ある関東軍防疫給水部である通称731部隊が、1936年に編成された。終戦から4年後に、旧ソ連の軍事ハバロスク裁判により、細菌兵器開発のために、生きた人間実験が証言された。731部隊が人体実験を、中国東北部ハルビンの郊外約20kmに、731部隊の本部跡周辺で実施した。3階建ビルには中央には周囲から遮断した牢獄が設置され、人体実験材料の囚人が収容された。人体実験の死亡者は、約3,000人以上とされる。表向きは防衛目的の研究開発を進めるため、全国の大学から医学者を集めて最大約3,000人に達した。石井式無菌濾水機を開発して、731部隊となった石井四郎の出身大学である京都大学が最も多く、次いで東京大学であった。約1年間の医学教育を受けた少年隊員も招集された。1937年に、日中戦争が勃発して、中国側の激しい抗戦で日本側の犠牲も増えた。日本軍は反抗する中国人らを匪賊として、掃討作戦を行った。匪賊に対する敵意が高まり、世論は軍による処刑を支持した。戦争が泥沼化していった1940年代に、731部隊は中国中部の複数の都市で少なくとも約3回、細菌を散布した。戦争末期の1945年8月9日に、ソ連が満州に侵攻して、731部隊はただちに撤退を始めて、証拠隠滅のため、全囚人を殺害して焼却して、実験施設を徹底的に破壊した。一部は、ソ連軍の捕虜となり、ハバロスク裁判で審判された。
